期刊简介
《世界中西医结合杂志》是由中国科学技术协会主管，中华中医药学会主办的医学类科技期刊（月刊，CN11-5511/R，ISSN1673-6673），本刊遵循“以中为本、西为中用”的原则，立足中国，面向世界。开设专家论坛、名医经验、医史文献、实验研究、临床研究、针灸研究、药物研究、思路与方法、综述等栏目，充分展示国内外中医药与中西医结合研究领域的新方法、新成果、新进展，为继承和宣扬中医药学，提高中医药学的国际地位，促进中医药走向世界做出贡献。本刊以国内外中医药、中西医结合临床、科研、教学人员为读者对象。
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首页>世界中西医结合杂志
- 杂志名称：世界中西医结合杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华中医药学会
- 国际刊号：1673-6613
- 国内刊号：11-5511/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：第四届全国中医药优秀期刊二等奖期刊收录：统计源核心期刊, 知网收录期刊, 维普收录期刊, 万方收录期刊, 哥白尼索引(波兰), 剑桥科学文摘, 国家图书馆, 上海图书馆
基于左归丸作用于高糖负荷小鼠胚胎细胞RNA-seq数据的3种差异基因分析方法的比较与分析
梁琦；冯前进；屈志鹏；王颖丽；白特玛喀；宋强
关键词：RNA测序技术, 中医药研究, cuffdiff, DESeq2, edgeR
摘要：目的 以具体实验数据为例探讨在使用RNA测序技术时如何选择恰当的数据处理方法.方法 以左归丸作用于高糖负荷的小鼠胚胎的转录组数据为例,分别运用目前通过转录组数据进行差异表达基因分析常用的cuffdiff、DESeq-2、edgeR 3种数据处理方法对数据进行了处理.结果不同的数据处理方法得到的差异基因数及后续的分析结果均出现了明显的不同.纵使基于共同的计算理念,参数选择的不同除了导致差异基因数的不同之外,差异基因在组间的差异程度上也会受到很大影响.这种差异会导致对相应研究目的的阐释出现偏差.结论 在运用生物信息学恰当地处理和分析RNA测序技术带来的海量数据时,根据研究内容选择恰当的基因表达差异分析方法至关重要.
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